Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ryr1E9PZQ0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms