Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scaf11E9PZM7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Scaf11E9PZM7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms