Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Rsf1E9PWW9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Rsf1E9PWW9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Rsf1E9PWW9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Rsf1E9PWW9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Rsf1E9PWW9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rsf1E9PWW9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms