Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc17E9PVB5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc17E9PVB5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms