Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim5E9PV98 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim5E9PV98 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms