Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.6 ms