Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms