Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ldlrad1D3YYZ1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ldlrad1D3YYZ1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ldlrad1D3YYZ1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ldlrad1D3YYZ1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ldlrad1D3YYZ1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ldlrad1D3YYZ1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ldlrad1D3YYZ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ldlrad1D3YYZ1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ldlrad1D3YYZ1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ldlrad1D3YYZ1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms