Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SafbD3YXK2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SafbD3YXK2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SafbD3YXK2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SafbD3YXK2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SafbD3YXK2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SafbD3YXK2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms