Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfia1B2RXQ2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia1B2RXQ2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms