Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc11B2RXC1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc11B2RXC1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc11B2RXC1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms