Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cspp1B2RX88 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms