Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700018F24RikB2RW27 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700018F24RikB2RW27 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms