Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms