Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed5B2RPU8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed5B2RPU8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms