Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cldn34b1B1AZQ8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn34b1B1AZQ8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn34b1B1AZQ8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34b1B1AZQ8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34b1B1AZQ8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34b1B1AZQ8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34b1B1AZQ8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34b1B1AZQ8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34b1B1AZQ8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34b1B1AZQ8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34b1B1AZQ8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms