Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nfx1B1AY10 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfx1B1AY10 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms