Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Col4a6B1AVK5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col4a6B1AVK5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a6B1AVK5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms