Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfap221A9Q751 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms