Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF0

Skint3, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint3A7TZF0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skint3A7TZF0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint3A7TZF0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint3A7TZF0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint3A7TZF0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint3A7TZF0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint3A7TZF0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint3A7TZF0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint3A7TZF0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint3A7TZF0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint3A7TZF0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skint3A7TZF0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Skint3A7TZF0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms