Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
4930435E12RikA6X8Z9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms