Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ttll11A4Q9F4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms