Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra4A2RT60 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Htra4A2RT60 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms