Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1jA2BFR3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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