Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Upf2A2AT37 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Upf2A2AT37 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms