Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtcflA2APF3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms