Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c4A2ANA3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c4A2ANA3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms