Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GabreA2AMW3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GabreA2AMW3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms