Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FocadA2AKG8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FocadA2AKG8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FocadA2AKG8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FocadA2AKG8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FocadA2AKG8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FocadA2AKG8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FocadA2AKG8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FocadA2AKG8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FocadA2AKG8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FocadA2AKG8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FocadA2AKG8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FocadA2AKG8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FocadA2AKG8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FocadA2AKG8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FocadA2AKG8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FocadA2AKG8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FocadA2AKG8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FocadA2AKG8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FocadA2AKG8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FocadA2AKG8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms