Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.6 ms