Protein–RNA interactions for Protein: A2AHM1

Gm5072, Predicted gene 5072, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5072A2AHM1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5072A2AHM1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5072A2AHM1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms