Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C87977A2A958 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C87977A2A958 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C87977A2A958 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C87977A2A958 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87977A2A958 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87977A2A958 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87977A2A958 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C87977A2A958 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C87977A2A958 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms