Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
Prdm16A2A935 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Prdm16A2A935 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prdm16A2A935 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms