Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Prdm2A2A7B5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm2A2A7B5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prdm2A2A7B5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Prdm2A2A7B5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prdm2A2A7B5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prdm2A2A7B5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prdm2A2A7B5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prdm2A2A7B5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms