Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calcoco2A2A6M5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Calcoco2A2A6M5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms