Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul4bA2A432 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cul4bA2A432 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms