Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVP8

Gm5580, Predicted pseudogene 5580, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5580A0A0N4SVP8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm5580A0A0N4SVP8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5580A0A0N4SVP8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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