Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms