Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H9

Igkv1-132, Immunoglobulin kappa variable 1-132 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms