Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trbv23A0A0A6YWQ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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