Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B657

Trdv1, T cell receptor delta variable 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv1A0A075B657 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv1A0A075B657 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv1A0A075B657 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv1A0A075B657 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv1A0A075B657 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv1A0A075B657 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms