Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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