Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms