Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms