Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms