Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms