Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Scamp5Q9JKD3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms