Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm6460-201ENSMUST00000088616 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms