Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms