Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms